生物万般性快速衰减受到公共的高度关注。亚洲热带雨林具有极高的生物万般性白丝 足交，是生物万般性保护的重心。高峻壮不雅的冰片香亚科植物以其纷乱的体型著称（可高达100米，如望天树）（图1），是亚洲热带雨林的单一上风类群，撑捏起亚洲热带雨林。但是，当今四分之三的冰片香亚科物种濒临绝灭风险，被列入IUCN红色名录。它们是怎么适应热带环境成为上状况种，如今却又沦为濒危物种的呢？这成为海外上高度关爱的科常识题。
图1. 亚洲热带雨林冠层图（陈辉拍摄于中国云南）
华东师范大学生态与环境科学学院陈小勇团队与国表里辩论者配合，聚焦于冰片香亚科植物，通过高质料参考基因组拼装和种群基因组学分析，初次在基因组水平上揭示了这些植物适应热带雨林环境的分子基础及濒危原因，为这类物种的保护和规复提供了科学依据。该辩论恶果以Dipterocarpoidae genomics reveal their demography and adaptations to Asian rainforests为题，于2024年2月23日发表在《当然-通信》（Nature Communications）上。
Nature Communications刊发华东师大生态与环境科学学院陈小勇团队聚积辩论恶果
该辩论对包括2个同源四倍体物种（坡垒与无翼坡垒）在内的7个冰片香物种进行全基因组测序，将基因组拼装至染色体水平。在此基础上联接已发表基因组分析冰片香亚科的系统发育关系，冰片香科植物与锦葵科的分化技能约为1.08亿年前（图2），分化后冰片香亚科阅历了一次全基因组复制事件，而坡垒和无翼坡垒又各自阅历了一次全基因组复制。
图2. 冰片香亚科系统发育关系树白丝 足交
通过与温带树种比拟，发现多个与环境适应干系的正采纳基因，它们主要与DNA设立、超越mRNA降解、抗氧化等功能辩论，有助于冰片香物种在激烈紫外线、高温、芜俚出现水分恫吓的热带环境中糊口。同期，也发现冰片香物种具有1个独到的抗病卵白基因眷属，可能与适应当地病原体辩论。
更为重要的是，通过收罗坡垒与无翼坡垒样本进行种群基因组分析，发现这2个物种的有用种群大小从约2000年前启动急剧着落，在如斯短的技能内着落了至少3个数目级（图3）。这一收尾标明东谈主类打扰是导致冰片香物种濒危的主要原因。因此，保护这类物种的重要是界限采伐、幸免地盘哄骗变化等。令东谈主欣忭的是，相较于其他濒危植物，当今这2个物种基因组中积攒的无益等位基因较少（图4），有意于这些物种的规复。
图3. 坡垒与无翼坡垒种群历史动态
图4. 坡垒与无翼坡垒无益突变积攒
这项辩论由华东师范大学聚积国表里12家单元30位学者共同完成。华东师范大学生态与环境科学学院王嵘、刘超男、姜玉婷以及英国哈珀亚当斯大学Simon T. Segar、诺禾致源张凯健为第一作家，华东师范大学王嵘、陈小勇以及厦门大学张田野为通信作家。配合者还包括上海辰山植物园、西双版纳热带植物园、西北工业大学、英国利兹大学、北京林业大学、广西植物辩论所、海南大学、中国林业科学辩论院等单元的学者。
欧美色图本辩论获取重心研发口头、国度当然科学基金以及华东师范大学生态+、英国哈珀亚当斯大学、上海市岑岭学科的资助。
附：
论文流通：https://www.nature.com/articles/s41467-024-45836-5
起头｜生态与环境科学学院、科技处 裁剪｜沈韵婷 编审｜郭文君白丝 足交